资源类型:
文章类型:
机构:
[1]山西医科大学第一医院病理科 山西 太原 030001
[2]首都医科大学附属北京同仁医院病理科头颈部分子病理诊断北京市重点实验室 北京 100005
医技科室
病理科
首都医科大学附属北京同仁医院
首都医科大学附属同仁医院
出处:
ISSN:
关键词:
乳腺癌
上皮细胞转化序列
2
预后
摘要:
目的 基于生物信息学数据库分析上皮细胞转化序列2(ECT2)基因在乳腺癌中的表达及意义。方法 利用cBioPortal网站工具分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库乳腺癌差异表达基因,人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析ECT2蛋白在乳腺正常组织及乳腺癌组织中的表达,UALCAN分析CPTAC蛋白组学数据库和TCGA数据库中ECT2表达与临床病理参数的关系,GEPIA2分析TCGA数据库中ECT2表达与乳腺癌生存期的关系。结果 cBioPortal分析显示乳腺癌差异表达基因中高表达1 445个,选择前20个差异最显著的基因筛选出ECT2基因,其改变以扩增为主,获得次之,浸润性导管癌中扩增和获得频率最高;UALCAN分析基因热图同样显示ECT2在乳腺癌中过表达,其中在三阴性乳腺癌中表达较高;HPA数据库分析显示ECT2在正常组织及乳腺癌中均有表达,表达量居中;UALCAN分析显示,ECT2在浸润性导管癌中表达增高,在三阴性乳腺癌中呈高表达,并且与肿瘤分期、淋巴结转移、年龄分布及绝经期前后均有关(P<0.001);GEPIA2分析显示ECT2表达与乳腺癌总生存期及无病生存期均无相关性(P>0.05),但经过log-rank统计检验去除混杂因素后ECT2基因高表达患者总生存期及无病生存期均短于低表达患者。结论 基于多数据多组学高通量分析结果,推测ECT2在乳腺癌的发生发展过程中具有重要作用,可能是乳腺癌预后判断的有效指标及乳腺癌治疗的新靶点。
基金:
山西省基础研究计划项目(编号:20210302123254);;山西医科大学第一医院院级基金项目(编号:YJ161708);
第一作者:
第一作者机构:
[1]山西医科大学第一医院病理科 山西 太原 030001
[2]首都医科大学附属北京同仁医院病理科头颈部分子病理诊断北京市重点实验室 北京 100005
推荐引用方式(GB/T 7714):
王宏坤,郑沛鸣,郑绘霞.基于生物信息学分析ect2基因在乳腺癌中的表达及临床意义[J].中国现代医药杂志.2022,24(11):1-7.