资源类型:
收录情况:
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
文章类型:
机构:
[1]首都医科大学附属北京同仁医院内分泌科,北京 100730
临床科室
内分泌科
首都医科大学附属北京同仁医院
首都医科大学附属同仁医院
[2]北京市糖尿病研究所,北京 100730
研究所
糖尿病研究所
首都医科大学附属北京同仁医院
首都医科大学附属同仁医院
[3]北京老年医院内分泌科,北京 100089
[4]北京市海淀医院感染性疾病科,北京 100080
出处:
ISSN:
关键词:
糖尿病视网膜病变
血清蛋白质组学
生物标志物
液相质谱
摘要:
目的 利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tag for relative and absolute quantification, iTRAQ)蛋白质组学技术,分析糖尿病增殖期视网膜病变(proliferative diabetic retinopathy, PDR)患者与糖尿病无视网膜病变患者(diabetes patients without retina diseases, NDR)之间蛋白表达的差异,寻找PDR的候选血清标志物。方法 收集2016年至2017年首都医科大学附属北京同仁医院内分泌科住院的PDR患者21例,以及性别年龄匹配的NDR患者21例。患者血清样本混匀后提取蛋白,采用iTRAQ标记,并进行液相质谱-串联质谱检测(liquid chromatograph-mass spectrometer and mass spectrometer, LC-MS/MS)分析,筛选出差异蛋白行基因本体论(Gene Ontology, GO)数据库功能富集及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome, KEGG)通路显著性富集分析。对相对定量结果进行独立样本t检验,通过差异倍数(fold change, FC)和P值判定蛋白表达量变化。结果 以差异倍数>1.2倍(上/下调),P值≤0.05为标准,筛选出差异蛋白29个,其中PDR组上调蛋白8个,下调蛋白21个。通过对差异蛋白的GO功能显著性富集分析,结果显示,差异基因的功能可分为生物过程、细胞组分和分子功能三个板块。差异表达基因功能涉及生物调节、细胞组成、细胞代谢过程、细胞结合和催化活性等方面。KEGG通路显著性分析显示,上调最为明显的血管紧张素转换酶(angiotensin converting enzyme, ACE)参与肾素-血管紧张素系统(renin angiotensin system, RAS)、肾素分泌等通路,上调蛋白——胰岛素样生长因子I(insulin like growth factor I,IGF-1)参与HIF-1、FoxO、mTOR、PI3K-Akt和AMPK等多条与代谢相关的信号通路。下调显著的蛋白——肌球蛋白6(myosin-6)参与心肌细胞收缩和信号传导通路。结论 采用iTRAQ蛋白质组学分析显示,PDR患者与NDR患者存在多种蛋白表达差异,ACE、IGF-1和Myosin-6有望作为糖尿病视网膜病变候选血清诊断标志物,未来可能为PDR的诊断和治疗提供新的靶点。
基金:
国家自然科学基金项目 ( 81561128015, 81930019),国家重点研发计划项目 ( 2017YFC0909600), 北京市属医院科研培育项目(PX2020008)
第一作者:
第一作者机构:
[1]首都医科大学附属北京同仁医院内分泌科,北京 100730
[2]北京市糖尿病研究所,北京 100730
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
杨芳远,彭诗洁,刘婧,等.应用蛋白质组学探索2型糖尿病增殖期视网膜病变潜在生物标志物[J].首都医科大学学报.2024,45(03):385-391.