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口腔鳞状细胞癌患者血浆lncrnas差异表达谱的初步研究

Differential expression profile of plasma lncRNAs in patients with oral squamous cell carcinoma

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]首都医科大学附属北京同仁医院口腔科 [2]首都医科大学附属北京地坛医院口腔科 [3]首都医科大学附属北京口腔医院黏膜科
出处:

关键词: 口腔鳞状细胞癌 长链非编码RNA 差异表达基因 lncRNA芯片

摘要:
目的:筛选与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),探讨OSCC相关lncRNAs在OSCC的发生、发展中的潜在作用机制。方法:选取OSCC TNM Ⅲ/Ⅳ期患者和健康对照组各3例,应用Arraystar人类lncRNA芯片(v4. 0)进行mRNA和lncRNA表达谱研究,对差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行GO和KEGG分析。结果:共有6606个lncRNAs表达有差异,其中上调3511个,下调3095个;有4196个mRNAs表达有差异,其中上调1766个,下调2430个。GO和KEGG分析显示DEGs功能涉及到肿瘤细胞的生长、分化、代谢、凋亡、信号传导等整个细胞周期过程,和肿瘤的增殖、迁移、侵袭等生物学行为密切相关。结论:筛选出了OSCC相关的差异表达lncRNAs,生物信息学分析提示它们参与了OSCC的发生、发展过程,是OSCC潜在的诊断和预后标志物,其作用机制还需要进一步验证。

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第一作者机构: [1]首都医科大学附属北京同仁医院口腔科
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