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mir-1254在结肠癌中调控差异表达基因及信号通路研究

Differentially expressed genes and signal pathways regulated by miR-1254 in colon cancer

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]北华大学医学院病原生物学教研室 [2]上海交通大学医学院附属同仁医院内窥镜室
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关键词: miR-1254 结肠癌 高通量RNA测序分析

摘要:
目的探讨miR-1254对结肠癌发生发展的影响及其在结肠癌中调控的差异表达基因(DEG)和信号通路。方法在人结肠癌细胞系SW1116中瞬转miR-1254模拟体,通过高通量RNA测序分析(RNA-seq),筛选出受miR-1254调控的DEG,由生物信息学分析这些DEG所涉及的信号通路和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。结果通过RNA-seq,筛选出了217条DEG。其中,121条下调基因,96条上调基因。这些基因主要富集在p53信号通路、氨酰-tRNA生物合成和内吞、甘氨酸/丝氨酸/苏氨酸代谢以及N-聚糖生物合成等信号通路中。PPI网络显示,结合蛋白较多的5个中心节点蛋白为UMPS、EGR1、CDKN1A、YARS以及ASNS。结论 miR-1254是一个多功能miRNA,在结肠癌发生发展中起重要作用。

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第一作者:
第一作者机构: [1]北华大学医学院病原生物学教研室
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