资源类型:
                
                    
                        
                        
                    
                
            
        
            
                收录情况:
                
                            ◇ 统计源期刊
                            ◇ CSCD-E
                
            
                        
            文章类型:
            
                
                    
                
            
        
            
                    
                机构:
                
                        
                            [1]首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科,耳鼻咽喉头颈科学教育部重点实验室(首都医科大学),北京市耳鼻咽喉科研究所,教育部工程中心,鼻病研究北京市重点实验室,中国医学科学院慢性鼻病创新单元
                                临床科室
                                耳鼻咽喉-头颈外科
                                外科
                                研究所
                                耳鼻咽喉科研究所
                                首都医科大学附属北京同仁医院
                                首都医科大学附属同仁医院
                                头颈外科
                                咽喉科
                        
                        
                            [2]首都医科大学附属北京同仁医院变态反应科
                                临床科室
                                变态反应科
                                首都医科大学附属北京同仁医院
                                首都医科大学附属同仁医院
                        
                
            
        
        
            出处:
            
                
                    
                
            
        
        
                    
                        
        
        
            关键词:
            
                    
                        嗜酸细胞
                    
                    
                        鼻窦炎
                    
                    
                        基因组学
                    
                    
                        数据库
                    
                    
                        嗜酸性粒细胞型慢性鼻窦炎伴鼻息肉
                    
                    
                        非嗜酸性粒细胞型慢性鼻窦炎伴数据库
                    
                    
                        非嗜酸性粒细胞型慢性鼻窦炎伴鼻息肉
                    
                    
                        转录组学
                    
                    
                        GEO数据库
                    
                    
                        诊断模型
                    
            
        
            
                
                    
                        
                        摘要:
                        
                            目的 本研究利用GEO数据库中的RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)数据,筛选出对嗜酸性粒细胞型慢性鼻窦炎伴鼻息肉(eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps,ECRSwNP)具有潜在诊断价值的基因。方法 共获得3个数据集数据,分别根据CST1和CLC基因的表达水平将样本分为ECRSwNP和非嗜酸性粒细胞型慢性鼻窦炎伴鼻息肉(nonECRSwNP)两组。使用R软件及算法建立ECRSwNP的诊断模型并检测其性能。结果 将每个数据集均分为两组GSE136825(ECRSwNP 7、nonECRSwNP 19),GSE72713(ECRSwNP 3、nonECRSwN 3),GSE179265(ECRSwNP 11、nonECRSwNP 2)。基于支持向量机(support vector machine,SVM)算法构建的上调基因模型(ADH1C、CCL26、HRH1、NOS2)和下调基因模型(LCN2、MUC5B、PLAT、TMEM45A、XDH)的ECRSwNP诊断性能表现出色。结论 基于SVM模型鉴定出的基因可能成为无创诊断ECRSwNP的生物学标志物,也可能在ECRSwNP发病机制中扮演关键角色。
                        
                     
                 
            
                    
                基金:
                
                    
                        国家自然科学基金(82025010、81630023、82171108、
81900917、81870698、82301329)
                    
                
             
        
            
        
                
        
        
                        
                    第一作者:
                    
                        
                            
                        
                    
                
                
                    第一作者机构:
                    
                                
                                    [1]首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科,耳鼻咽喉头颈科学教育部重点实验室(首都医科大学),北京市耳鼻咽喉科研究所,教育部工程中心,鼻病研究北京市重点实验室,中国医学科学院慢性鼻病创新单元
                                
                    
                
                        
                    通讯作者:
                    
                        
                            
                        
                    
                
                    
                推荐引用方式(GB/T 7714):
                
                    
                        黄雨晴,孟琛,廖健宏,等.基于geo数据集分析嗜酸性粒细胞型慢性鼻窦炎伴鼻息肉的潜在诊断基因[J].中国耳鼻咽喉头颈外科.2023,30(12):781-784.