资源类型：
期刊
Pubmed体系：
Journal Article
收录情况：
◇ 统计源期刊
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◇ 卓越：梯队期刊
◇ 中华系列
文章类型：
论著
机构：
[1]首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科 教育部重点实验室耳鼻咽喉头颈科学 北京市头颈部分子病理重点实验室 100730
临床科室
耳鼻咽喉-头颈外科
外科
首都医科大学附属北京同仁医院
首都医科大学附属同仁医院
头颈外科
出处：
中华耳鼻咽喉头颈外科杂志.2020,55(2):125-132.
ISSN：
1673-0860
关键词：
下咽肿瘤
癌
鳞状细胞
基因表达谱
诱导化疗
生物信息学
摘要：
目的 应用基因表达谱芯片,筛选下咽鳞状细胞癌患者对紫杉醇+顺铂+5-氟尿嘧啶(TPF)方案诱导化疗敏感性的差异表达基因,并进行初步分析.方法 选取2013年1月至2017年12月北京同仁医院头颈外科29例原发下咽鳞状细胞癌患者(男28例,女1例,年龄43～73岁)TPF方案诱导化疗治疗前的新鲜肿瘤标本.分为诱导化疗敏感组(16例)和不敏感组(13例).应用Illumina人类全基因组表达芯片检测2组的表达差异,对差异基因进行生物信息学分析.在29例样本基础上增加符合入组条件的14例样本,应用反转录实时定量聚合酶链反应(reverse transcription and quantitative real-time PCR,RT-qPCR)技术检测潜在功能核心基因在诱导化疗敏感组患者及诱导化疗不敏感组患者组织中表达的差异.采用Graphpad prism 7.0软件对测量结果进行统计分析.结果 共筛选出1 381个差异基因.经GO (Gene Ontology)数据库分析,功能上调的集合主要包括:细胞外基质隔离、趋化因子受体结合、钾离子通道调节活性等集合;下调的集合包括:血管生成调节、钙离子结合、自然杀伤细胞免疫应答活性等集合.经KEGG(Kyoto Encyclopediaof Genes and Genomes)数据库分析,下调通路主要有:细胞外基质受体相互作用通路、过氧化物酶体通路等;上调通路主要有:谷胱甘肽代谢通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor,PPAR)信号通路等.其中CD44、IL-6R分别为表达下调基因和上调基因,可能位于核心功能调控位置.经RT-qPCR检测,CD44 mRNA在诱导化疗不敏感组织中相对表达量(0.54±0.06)显著高于诱导化疗敏感组织(0.33±0.04)中相对表达量(P＜0.01);IL-6R mRNA在诱导化疗不敏感组织中相对表达量(0.44±0.03)显著低于诱导化疗敏感组织中相对表达量(0.68±0.03),差异有统计学意义(P＜0.01).结论 CD44、IL-6R可能是下咽鳞状细胞癌TPF诱导化疗敏感性相关的潜在功能性基因.
基金：
北京市医院管理局“登峰”人才培养计划;首都卫生发展科研专项;北京市教育委员会科技发展计划重点项目;北京市自然科学基金资助项目(7184196)Beijing Municipal Administration of Hospitals' Ascent Plan;Capital Health Development Research Project;Beijing Natural Science Foundation Program and Scientific Research Key Program of Beijing Municipal Commission of Education;Beijing Natural Science Foundation
PubmedID：
32074750
第一作者：
杨一帆
第一作者机构：
[1]首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科 教育部重点实验室耳鼻咽喉头颈科学 北京市头颈部分子病理重点实验室 100730
通讯作者：
房居高
推荐引用方式(GB/T 7714)：
杨一帆,房居高,钟琦,等.下咽鳞状细胞癌TPF方案诱导化疗敏感性差异基因的初步分析[J].中华耳鼻咽喉头颈外科杂志.2020,55(2):125-132.
