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代谢组学与转录组学联合分析揭示变应性鼻炎小鼠鼻黏膜免疫-代谢机制及关键调控基因

Integration of metabolomic and transcriptomic analysis elucidates immune-metabolic mechanisms and key regulatory genes in allergic rhinitis mouse nasal mucosa

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资源类型:

收录情况: ◇ 中华系列

机构: [1]首都医科大学附属北京朝阳医院检验科,北京 100020 [2]首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科,北京 100730 [3]北京市耳鼻咽喉科研究所、过敏性疾病北京实验室(北京市教育委员会)和慢性鼻病新药及诊断技术研发北京市重点实验室,北京 100005 [4]首都医科大学附属北京同仁医院变态反应科,北京 100730
出处:
ISSN:

关键词: 鼻炎 变应性 小鼠 鼻黏膜 卵清蛋白 代谢组学 嗜酸性粒细胞趋化因子11

摘要:
目的 探究卵清蛋白(OVA)诱导小鼠变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)的分子调控机制,联合转录组学和代谢组学技术,系统阐明AR发生和发展的关键代谢通路和调控基因.方法 采用OVA致敏法构建BALB/c小鼠AR模型,通过鼻部黏膜评分、血清IgE和细胞因子检测及鼻黏膜病理学验证模型有效性.使用Seriomics一步法(甲基叔丁基醚-甲醇-水三相溶剂体系)提取样本,联合超高效液相色谱-高分辨质谱法(UPLC-HRMS)进行非靶向代谢全谱检测,得到差异代谢物.联合GEO数据库,筛选差异基因,对差异基因和差异代谢物所在通路进行联合分析,确定AR疾病发生的免疫·代谢通路和调控基因.结果 实验得到OVA组下调差异代谢物43种,差异表达基因910个,其中上调477个,下调433个.差异代谢物主要参与氨基酸和糖类的生物合成及代谢过程,差异基因与炎症反应和2型免疫反应密切相关.代谢组学和转录组学联合分析揭示了关键调控基因嗜酸性粒细胞趋化因子11(Ccl11)和C型甘露聚糖受体1(Mrc1)可能通过影响缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的降解、苯丙氨酸代谢以及精氨酸和脯氨酸代谢,来参与AR免疫调控过程.结论 研究揭示了免疫相关基因Ccl11和Mrc1通过特定代谢通路调控AR的分子机制,为理解AR的分子路径提供了新的视角,同时将Ccl11和Mrc1作为潜在的治疗靶点,为未来的研究和治疗策略提供重要的参考.

语种:
第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学附属北京朝阳医院检验科,北京 100020
通讯作者:
通讯机构: [2]首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科,北京 100730 [3]北京市耳鼻咽喉科研究所、过敏性疾病北京实验室(北京市教育委员会)和慢性鼻病新药及诊断技术研发北京市重点实验室,北京 100005 [4]首都医科大学附属北京同仁医院变态反应科,北京 100730
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