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1型糖尿病小鼠心肌组织mir-142-3p的lncrna和circrna靶标分析

Bioinformatics analysis of IncRNA and circRNA targeting miR-142-3p in type 1 diabetic mice

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]上海交通大学附属第六人民医院超声医学科上海超声医学研究所 [2]上海交通大学医学院附属同仁医院超声医学科
出处:

关键词: 糖尿病 心肌 生物信息学

摘要:
目的:利用生物信息学对1型糖尿病小鼠心肌组织中微小RNA(miR)-142-3p进行长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)靶标预测。方法:22只C57小鼠随机分为糖尿病模型组(n=15)和对照组(n=7),糖尿病模型组小鼠经腹腔一次性注射链脲佐菌素(STZ)建立1型糖尿病小鼠模型,对照组注射柠檬酸缓冲液。建模8周后终止实验,检测左室质量指数(LVWI)和心脏功能,HE染色结合定量分析软件检测心肌细胞大小;通过miRNA表达谱芯片技术甄别miRNAs的差异性,qRT-PCR确定差异表达;采用微小RNA靶标分析软件miRanda和TargetScan进行靶标预测,对预测到的circRNA宿主基因(host gene)进行基因功能聚类解析。结果:(1)糖尿病模型组心肌组织中miR-142-3p表达显著降低;(2)在高严谨条件下,用miRanda和TargetScan能够同时预测到miR-142-3p的靶标lncRNA有35个、circRNA有14个;(3)宿主基因功能预测显示miR-142-3p参与糖代谢相关的信号通路。结论:miR-142-3p可能通过调控部分lncRNA和circRNA,参与糖尿病心肌病的发生。

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第一作者:
第一作者机构: [1]上海交通大学附属第六人民医院超声医学科上海超声医学研究所
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