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丝状真菌质谱鉴定前处理方法及应用

The research and application of pretreatment method for matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry identification of filamentous fungi

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收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-C ◇ 中华系列

机构: [1]首都医科大学附属北京同仁医院检验科 [2]北京市海淀医院检验科 [3]解放军军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室
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关键词: 真菌 水平震荡法 改良磁珠提取法

摘要:
目的建立并评价实验室自行研发的丝状真菌质谱鉴定前处理方法的可行性。方法复苏2014年1月至2016年12月北京同仁医院菌库中380株丝状真菌菌株,沙保弱葡萄糖琼脂平板(SDA)28℃培养至成熟状态同时使用Bruker仪器推荐的垂直旋转法培养和本实验室研发的"水平震荡法"培养至足量菌落。3种方法培养菌株均采用"改良磁珠提取法"提取蛋白行质谱鉴定。结果380株真菌菌株,使用SDA培养时间需要310 d,鉴定到种和属的比率分别是47%和81%;使用Bruker仪器推荐方法培养时间需要57 d,鉴定到种和属的比率分别是76%和94%;"水平震荡法"培养时间只需12 d,鉴定到种和属的比率分别是96%和99%。"水平震荡法"和SDA培养法比较,差异有统计学意义(χ2=39.026,P(0.01),和仪器推荐的方法比较,差异有统计学意义(χ2=11.310,P(0.01)。结论本实验室研发的"水平震荡法"和"改良磁珠提取法"优于仪器推荐的方法和SDA培养鉴定方法,可以应用到临床。

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第一作者机构: [1]首都医科大学附属北京同仁医院检验科
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