目的比较预防接种门诊采用不同工作模式查验中小学新生预防接种证的疫苗补种效果。方法选取北京市8家社区卫生服务中心预防接种门诊及其辖区33家中小学为调查对象,收集预防接种门诊2012—2014年6—9月间全部疫苗接种数据资料,以及2012—2014年夏季入学接种证查验工作报表数据,包括纸质版模式和电子版模式。疫苗漏种判定依据《北京市免疫规划疫苗常规查漏补种要求》2012版中的规定执行,由保健科专业医务人员对漏种情况和漏种判定的准确与否进行最终裁定。结果流动儿童比例)50%的学校新生疫苗漏种率为26.50%,高于流动儿童比例≤50%的学校新生疫苗漏种率的13.93%;截至9月30日,流动儿童比例)50%的学校新生疫苗漏种率为8.66%,高于流动儿童比例≤50%的学校新生疫苗漏种率的4.08%,差异均有统计学意义（t=21.33、25.77,P(0.05）。6月报名开始查验的新生首针补种率达到75.94%,高于9月开学开始查验的新生首针补种率的60.82%,差异有统计学意义（t=14.38,P(0.05）。截至9月30日,流动儿童比例)50%的学校新生全程接种率为66.92%,低于流动儿童比例≤50%的学校新生全程接种率的88.79%,差异有统计学意义（t=20.22,P(0.05）。9月开学开始查验的预防接种门诊接种信息电脑录入错误率为4.82%,高于6月报名开始查验的预防接种门诊接种信息电脑录入错误率的2.77%,差异有统计学意义（t=12.74,P(0.05）。结论各预防接种门诊应根据辖区中小学新生数量及流动儿童比例,采取合适的接种证查验工作模式,由保健科医务人员进行查验具有较好的准确性。