目的对全飞秒激光角膜基质透镜切除术（Flex）与飞秒激光制瓣的LASIK（FS-LASIK）术后3个月近视散光患者的角膜形态进行比较研究。方法前瞻性病例对照研究。对2013年1-9月在北京同仁医院的近视散光患者165例（323眼）进行Flex（87例170眼）或FS-LASIK（78例153眼）手术,术后3个月时,对2组视力、屈光状态及角膜形态参数进行独立样本t检验。结果 Flex组和FS-LASIK组术后3个月时,logMAR UJCVA分别为-0.10±0.08和-0.11±0.10,矫正视力分别为-0.11±0.07和-0.12±0.07,均较术前BCVA（-0.07±0.03和-0.07±0.04）提高（t=4.083、5.594、3.458、6.440,P(0.01）,2种手术方式之间差异均无统计学意义（t=-0.811、-1.864,P)0.05）。Flex和FS-LASIK切削偏心量分别为（0.29±0.17）mm和（0.40±0.17）mm,二者差异有统计学意义（t=5.662,P(0.01）。Flex切削偏心程度与术前等效球镜度不相关（r=0.122,P)0.05）;FS-LASIK切削偏心程度与术前等效球镜度呈正相关（r=0.210,P(0.01）。Flex和FS-LASIK术后角膜表面规则指数（SRI）分别为0.34±0.25和0.22±0.21,二者比较差异有统计学意义（t=-4.627,P(0.01）。结论 Flex术后切削偏心程度比FS-LASIK小,FS-LASIK术后角膜表面规则性比Flex更好,二者术后都可获得满意的视力。