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pm2.5暴露对慢性鼻窦炎患者鼻黏膜上皮细胞影响的转录组学分析

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收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ CSCD-E

机构: [1]首都医科大学附属北京佑安医院耳鼻咽喉头颈外科 [2]首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科北京市耳鼻咽喉科研究所耳鼻咽喉头颈科学教育部重点实验室(首都医科大学)鼻病研究北京市重点实验室
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关键词: 颗粒物 转录组序列 鼻窦炎 鼻息肉 PM2 5 差异表达基因

摘要:
目的 研究PM2.5暴露对慢性鼻窦炎患者鼻黏膜上皮细胞(human nasal epithelial cells,HNECs)基因表达的影响,并探讨可能作用的机制。方法 6例慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的HNECs气液交界培养后分为对照组(PBS处理)和PM2.5组(100 μg/ml PM2.5处理),干预24h后提取各组细胞RNA进行转录组学测序(RNA sequencing,RNA-seq),筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并进行基因本体论(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,采用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-PCR)检测关键基因(CYP1A1、CYP1B1)的表达。结果 RNA-seq表明PM2.5组与对照组相比DEGs共279个,其中上调表达76个,下调表达203个,CYP1A1和CYP1B1是排名前两位的上调DEGs,而下调DEGs主要与DNA复制和蛋白质合成相关。通过GO和KEGG富集分析发现DEGs主要参与应激反应、氧结合、脂类物质代谢等,其中细胞色素P450(cytochrome P450,CYP450)酶起重要作用。RT-PCR结果显示,PM2.5组CYP1A1、CYP1B1表达量显著上调(P<0.05),这与RNA-seq测序结果一致。结论 PM2.5可能通过调控CYP450酶中相关基因的表达,影响脂类物质代谢诱导HNECs氧化应激和促炎反应。

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第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学附属北京佑安医院耳鼻咽喉头颈外科
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