目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOFMS）技术对临床分离的厌氧菌进行鉴定,与传统Vitek32ANI鉴定卡及16SrRNA基因序列法鉴定进行比较,分析MALDI-TOFMS技术用于鉴定临床常见厌氧菌的可行性。方法收集从临床标本培养分离的厌氧菌56株,运用MALDI-TOFMS技术对其进行鉴定,同时运用Vitke32ANI鉴定卡及16SrRNA基因序列法分别进行鉴定,将三者的结果进行比较。结果 56株厌氧菌中有41株采用MALDI-TOFMS技术鉴定至种的水平（分值大于或等于2.0）,11株鉴定至属的水平（分值为1.72.0）,4株无可靠结果（分值小于1.7）。MALDI-TOFMS和16SrRNA基因序列法鉴定结果一致的占94.6%（53/56）,不一致的占5.6%（3/56）。MALDI-TOFMS与Vitke32ANI鉴定卡的鉴定结果一致的占80.4%（45/56）,不一致的占19.6%（11/56）。结论 MALDI-TOFMS与16SrRNA基因序列法鉴定的符合率高,可应用于临床常见厌氧菌的鉴定。