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一种可预测弥漫大b细胞淋巴瘤患者生存的新型6基因预测模型

A novel six-gene based prognostic model for patients with diffuse large B-cell lymphoma

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]首都医科大学附属北京同仁医院血液科 [2]北京大数据精准医疗高精尖创新中心北京航空航天大学&首都医科大学北京同仁医院 [3]南方医科大学第二临床医学院南方医科大学珠江医院血液科
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关键词: 弥漫大B细胞淋巴瘤 基因预测模型 风险评分

摘要:
目的从分子生物学角度构建预测弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)预后的模型。方法从GEO和TCGA数据库下载相应的基因表达谱数据及临床数据,采用Lasso回归和多因素Cox回归构建基因预测模型,将基因模型与其他临床预后因素相结合构建列线图模型。结果本研究建立了基于6个基因(LNPEP、SNX20、GTPBP10、CALR、BDH1、C5orf30)的预测模型,该模型可将各个队列的患者分为高风险组及低风险组,训练集GSE10846及验证集GSE32918、NCICCR预测3年总生存率的AUC分别为0.722、0.758、0.693。基于该基因模型与年龄、亚型、治疗方案、ECOG、分期、结外部位数量等临床因素构建的列线图模型预测DLBCL患者3年总生存率的AUC在GSE10846数据集为0.796,校准图一致性良好。GO及KEGG富集分析显示,该模型的基因主要与DNA复制和修复、蛋白加工、细胞周期、病毒致癌等生物功能及通路相关。结论本研究成功构建了可预测DLBCL患者生存的基因预测模型,与临床因素结合,能更准确地评估患者的预后。

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第一作者:
第一作者机构: [1]首都医科大学附属北京同仁医院血液科 [2]北京大数据精准医疗高精尖创新中心北京航空航天大学&首都医科大学北京同仁医院
通讯作者:
通讯机构: [1]首都医科大学附属北京同仁医院血液科 [2]北京大数据精准医疗高精尖创新中心北京航空航天大学&首都医科大学北京同仁医院
推荐引用方式(GB/T 7714):

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