目的:通过对肿瘤基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库内胰腺导管腺癌（pancreatic ductal adrenocarcinoma,PDAC）相关数据的研究,从全基因组水平发现影响PDAC预后的甲基化位点及基因。方法:从TCGA网站下载2016年1月28日更新版本的有关PDAC的临床数据、甲基化数据（基于Illumina Methylation 450芯片）及转录组数据（基于Illumina Hiseq测序）。纳入兼具预后数据和甲基化数据的患者179例,应用Cox比例风险模型分析每个位点甲基化水平与PDAC患者总体生存率的关系。进一步纳入兼有甲基化数据及转录组数据的患者173例,分析甲基化水平与对应mRNA表达水平的关系。最后分析mRNA表达水平与PDAC患者总体生存率的关系。结果:用于甲基化预后分析的179例患者年龄为（64.64±10.96）岁,用于相关性分析和m RNA预后分析的173例患者年龄为（64.46±10.91）岁,两者中位生存时间均为20.1个月。本研究发现的与PDAC预后关系最显著的前20个甲基化位点中,11个位点的高甲基化水平为PDAC预后的危险因素,9个为保护因素。位于ZNF438基因5′UTR区的cg01656216探针靶向的位点与PDAC预后相关最显著（HR=0.37,95%CI:0.24～0.56,P=4.11×10-6）。进一步发现8个位点甲基化水平与相应mRNA表达水平呈负相关（r(-0.3,P (0.05）,其中PKP3（cg20268054）和EFNB2（cg22179913）的m RNA表达水平还与预后有关（HR=1.66,95%CI:1.06～2.61,P=0.027;HR=1.86,95%CI:1.21～2.88,P=0.005）。结论:通过对TCGA数据库PDAC样本的分析发现,PKP3和EFNB2基因的甲基化水平与PDAC预后相关,可进一步发掘其作为PDAC预后相关生物标志物的潜能。